|
|
Registrace obrazů - aplikace v oftalmologii a ultrasonografii
Harabiš, Vratislav ; Matula,, Petr (oponent) ; Zemčík, Pavel (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Registrace medicínských obrazů je v dnešních dnech široce používaná, ale zároveň je i jednou z oblastí zájmu vědeckého výzkumu. Stále nové a vylepšené zobrazovací systémy si žádají stále lepší a výkonnější metody registrace obrazu. Takovou oblastí je i kontrastní ultrazvukové zobrazování. Díky časové proměnlivému kontrastu v obraze, nízkému poměru signál/šum a specifickému šumu typu spekle je registrace ultrazvukových obrazu velice náročná. Dalším problémem je hodnocení kvality registrace. V této dizertační práci je představena metoda registrace ultrazvukových kontrastních sekvencí založena na automatické fragmentaci sekvence do podsekvencí. Následně jsou registrovány obrazy s podobnými vlastnostmi. Dále je představena nová metoda pro hodnocení kvality registrace na základě porovnání perfuzních modelů. Metoda registrace i hodnocení byla testována jak na datech získaných za pomocí fantomu, tak i na reálných pacientských datech. Výsledky pak byly porovnány se standardními metodami publikovanými v odborných článcích. Druhá menší část práce je tvořena ukázkami aplikací různých registračních metod v oftalmologii a návrhy na jejich zlepšení. Jedná se o oblast zobrazovacích systému, kde se registračních metod široce využívá. Kromě jasových registračních metod zde nachází velké uplatnění metody registrace založené na detekci významných bodů. Představené registrační přístupy tak směřují především k detekci těchto významných bodů a stanovení jejich vzájemných korespondencí v jednotlivých obrazech.
|
|
|
Analysis of Retinal Image Data to Support Glaucoma Diagnosis
Odstrčilík, Jan ; Kybic, Jan (oponent) ; Matula,, Petr (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Fundus camera is widely available imaging device enabling fast and cheap examination of the human retina. Hence, many researchers focus on development of automatic methods towards assessment of various retinal diseases via fundus images. This dissertation summarizes recent state-of-the-art in the field of glaucoma diagnosis using fundus camera and proposes a novel methodology for assessment of the retinal nerve fiber layer (RNFL) via texture analysis. Along with it, a method for the retinal blood vessel segmentation is introduced as an additional valuable contribution to the recent state-of-the-art in the field of retinal image processing. Segmentation of the blood vessels also serves as a necessary step preceding evaluation of the RNFL via the proposed methodology. In addition, a new publicly available high-resolution retinal image database with gold standard data is introduced as a novel opportunity for other researches to evaluate their segmentation algorithms.
|
|
|
Pokročilé zpracování oftalmologických video sekvencí retinálních obrazů
Říha, Pavel ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Jan, Jiří (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá registrací a analýzou snímků z experimentální nízkonákladové fundus kamery dosahující nízkého SNR (kolem 10 dB) a nízkého časového i prostorového rozlišení. Cílem diplomové práce je prozkoumání možností digitálních úprav vedoucích k vytvoření videosekvence mající reálný přínos pro lékařskou diagnostiku. K registraci je použit známý program elastix; předregistrační filtry i interpolace snímků jsou implementovány v Matlabu. Program poskytuje široké možnosti nastavení, z nichž bylo mnoho variant otestováno a vyhodnoceno. K posouzení dosažené přesnosti jsou vyhodnocovány prostorové odchylky v detekovaném pohybu cév. Nejlepších výsledků s přesností pod 0.3 px bylo dosaženo použitím pásmové propusti, vhodně velké masky a rigidní registrace s metrikou vzájemné informace. Testované sekvence se podařilo registrovat dostatečně přesně pro vizuální hodnocení i základní výpočetní analýzy. Hlavním přínosem této práce jsou zregistrované sekvence a vytvořená aplikace, které mohou být využity při dalším vývoji experimentální kamery.
|
|
|
Texturní analýza oftalmologických snímků
Kaňka, Jan ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Jan, Jiří (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá vytvořením programu pro texturní analýzu snímků retinální oblasti pomocí statistické metody co-occurrence matrices jako možnou alternativu detekce poškození sítnice glaukomem. Glaukomové onemocnění bez včasné diagnostiky a následné léčby vede k slepotě. Snímky sítnice pořízené fundus kamerou jsou běžné a velmi snadno zpracovatelné. Moderní přístroje jsou schopny zachytit snímek o rozlišení 10MPix a více, což zpřesňuje výstupy analytického software. Metoda co-occurrence analýzy je jednoduchá a velmi účinná statistika. Její nevýhodou je výpočetní náročnost, jenž přichází spolu s rostoucí objektivní kvalitou snímků.
|
|
|
Nástroj pro detekci a opravu snímků nemocemi poškozených sítnic oka
Jochlík, Jakub ; Semerád, Lukáš (oponent) ; Drahanský, Martin (vedoucí práce)
Ztráta či poškození zraku může mít velký dopad na kvalitu života člověka. Mezi nejčastější nemoci způsobující poškození či ztrátu zraku patří diabetická retinopatie a věkem podmíněná makulární degenerace, jejichž průběhu je možné předejít včasnou diagnózou. K zrychlení a zkvalitnění diagnózy v současnosti velmi přispívá používání fundus kamer. Tyto snímky pak lze automaticky vyhodnotit za účelem detekce možných projevů těchto onemocnění na sítnici. Tato práce se zaobírá jedním z možných způsobů automatické detekce projevů onemocnění na sítnici. V první části této práce je popsáno oko a jeho možné onemocnění, včetně technik snímání očního pozadí. Druhá část této práce pak navrhuje způsob automatizované detekce a její implementaci. Nakonec jsou zhodnoceny dosažené výsledky.
|
|
|
Metody hlubokého učení pro segmentaci cév a optického disku v oftalmologických sekvencích
Rozhoňová, Andrea ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Hesko, Branislav (vedoucí práce)
Cílem následující diplomové práce bylo studium problematiky segmentace optického disku a cév sítnice v oftalmologických sekvencích. Teoretická část práce shrnuje principy různých přístupů z oblasti hlubokého učení, které se v souvislosti s danou problematikou využívají. Na základě teoretické části jsou navrženy metody pro segmentaci optického disku a pro segmentaci cév sítnice založené na konvolučních neuronových sítích Linknet, PSPNet, Unet a MaskRCNN. Popisem jejich implementace a následným zhodnocením se zabývá praktická část diplomové práce.
|
|
|
Tvorba báze znalostí
Šiška, Jiří ; Musilová,, Lenka (oponent) ; Jirsík, Václav (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce se zabývá návrhem a tvorbou báze znalostí pro diagnostický expertní systém NPS se zaměřením na diagnostiku ektatických onemocnění rohovky. Součástí práce je i seznámení čtenáře se znalostním inženýrstvím a s vlastnostmi expertních systémů, jejich charakteristickými rysy a jejich aplikací.
|
|
|
Pokročilá registrace obrazových sekvencí z videooftalmoskopu
Dufková, Barbora ; Chmelík, Jiří (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se věnuje problematice registrace oftalmologických video sekvencí. Popisuje základní geometrické transformace, které lze k registraci využít. Jsou také uvedeny základní metody registrace obrazů, ze kterých je vybrána nejvhodnější varianta pro tuto aplikaci. Ta je poté implementována pomocí skriptu vytvořeného v prostředí MATLAB. Navržená metoda je dále objektivně vyhodnocena metodou jasového profilu, pomocí vzájemné informace a korelace a pomocí skeletonu sítnicových cév. V diskuzi je řešen vliv polynomiální transformace na registraci a možné optimalizace algoritmu.
|
|
|
Zaměstnávání osob se zrakovým postižením v historickém kontextu
Havelková, Veronika ; Mužáková, Monika (vedoucí práce) ; Šumníková, Pavlína (oponent)
Ve své práci se zaměřím na zhodnocení informací o zaměstnávání osob se zrakovým postižením v období 19. - 20. Století, a to především prostřednictvím činností slepeckých spolků a ústavů tehdejší doby. Dále bych se zmínila o historickém vývoji doby 19. - 20. století, a to z důvodu pochopení životní situace nevidomých a pochopení důvodů vzniku slepeckých spolků, které se zaměřovaly na pracovní uplatnění osob se zrakovým postižením. Dále hodnotím tradiční řemesla, která byla pro osoby se zrakovým postižením typická.
|
|
|
Kvalita života pacienta se zeleným zákalem
Hašková, Martina ; Jirkovský, Daniel (vedoucí práce) ; Králíčková, Jana (oponent)
Tato bakalářská práce se zabývá problematikou kvality života pacientů se zeleným zákalem. Jejím cílem je seznámit odbornou i laickou veřejnost s obtížemi a změnami, kterými jsou tito pacienti v průběhu života omezováni. Teoretická část práce stručně vymezuje kvalitu života a popisuje základní charakteristiku glaukomového onemocnění. V praktické části je popsáno vlastní šetření, které probíhalo od června do listopadu 2015 v oční ambulanci Oblastní nemocnice Kladno. Celkem bylo zařazeno 83 pacientů. Za metodou sběru dat byl zvolen dotazník, který obsahoval položky ze standardizovaných dotazníků NEI-VFQ-25 a GQL-15 a položky charakterizující respondenta. Z vlastního šetření vyplývá, že u zkoumaného vzorku respondentů lze pozorovat významné rozdíly v odpovědích podle pohlaví, věku, doby léčby s glaukomovým onemocněním a stupňem nejvyššího dosaženého vzdělání. V práci je také uveden stručný popis a výsledky již existujících studií na stejné či obdobné téma.
|
host ::
RSS.